台湾中正大学Abinit教程

rainsfield

大家可能都听说过GNU License下的免费软件abinit (www.abinit.org)
界面不如MS的CASTEP那么友好，但是被全世界研究者们广泛的使用。上交大的孙弘老师的工作就用了abinit code. 见我的另外一片关于PRL的帖子。
现在奉献给大家一个被我发掘出来的教程，哈哈。斑竹啊，这个也要加精华了吧？
感谢台湾中正大学的科学家的工作！

台湾中正大学Abinit教程 (好像主页上没有这个连接）
http://www.phy.ccu.edu.tw/~tcleung/Abinit/abinit.htm （见目录下的Chapter1,2,3...)
许多有用的范例下载：
http://www.phy.ccu.edu.tw/~tcleung/...ad/download.htm
梁贊全教授研究室主页：
http://www.phy.ccu.edu.tw/~tcleung/

还有好多好东西！

http://www.phy.ccu.edu.tw/~tcleung/new/news.htm

greencalm

我们的同胞怎么会有这么多的好东东呢 不设置为精华都不行 呵呵！

vv_china

不错啊！
尽管Abinit本身有很多的实例和相当详细的帮助文档，但还是看着中文教程舒服啊，呵呵
谢谢楼主给出的链接！

altf

ABINIT
（来自：http://zorkov.nease.net/free/abinit.html）

主页：http://www.abinit.org/

获得方法：直接下载。推荐注册。

简介：ABINIT的主程序使用赝势和平面波，用密度泛函理论计算总能量，电荷密度，分子和周期性固体的电子结构，进行几何优化和分子动力学模拟，用TDDFT（对分子）或GW近似（多体微扰理论）计算激发态。此外还提供了大量的工具程序。程序的基组库包括了元素周期表1-109号所有元素。ABINIT适于固体物理，材料科学，化学和材料工程的研究，包括固体，分子，材料的表面，以及界面，如导体、半导体、绝缘体和金属。

功能：
可以计算很多物理属性：
A. 计算倒格子中核与电子的总能量。
  A.1. 计算使用平面波和赝势。
  A.2. 总能量的计算使用密度泛函理论（DFT）。可以使用大多数重要的局域密度近似 (LDA)，包括Perdew-Zunger近似。可以使用两种不同的局域自旋密度(LSD)，包括Perdew Wang 92和M. Teter的LSD。还可以使用Perdew-Burke-Ernzerhof，revPBE，RPBE和HCTH等GGA (自旋极化和非极化)。
  A.3. 自恰场计算生成DFT基态，以及相关的能量和密度。此后的非自恰计算可以对能带结构的大量k-点产生本征能量。态密度的计算即可以用四面体方法，也可以用模糊技术。
  A.4. 程序可以使用多种不同的赝势。对整个周期表适用的有两种：Troullier-Martins型和Goedecker型（这种类型包括自旋-轨道耦合）。如果需要的话，有四个代码可以产生新的赝势。
  A.5. 程序本身可以处理金属和绝缘体系。
  A.6. 晶胞可以是正交或者非正交。计算可以输入任何对称性及相应的k-点集。
  A.7. 电子体系可以用自旋极化和自旋非极化计算。一个特殊的选项可以有效地处理反铁磁性。可以对总能量计算非共线的磁性（不能用于力，张量，相应函数...）。可以禁止晶胞的总磁矩。
  A.8. 总能量，力，张量和电子结构的计算可以考虑自旋-轨道耦合。
  A.9. 能量可分解为不同的成分（局域势，XC，Hartree...）。
  A.10. 计算内部电子本征值。
  A.11. 230个空间群和1191个Shubnikov磁群的对称性分析。
B. 计算总能量和本征能量
  B.1. 用解析公式计算Hellman-Feynman力。
  B.2. 计算应力。
  B.3. 极化的计算。
  B.4. 响应的计算。
  B.5. 计算近似的和准确的磁化系数矩阵和介电矩阵。
  B.6. 解析计算电子本征能量的导数。
  B.7. 计算光学传导性。
  B.8. Born有效电荷的能带分解，以及局域化张量的计算。
C. 激发态
  C.1. 用GW近似计算电离能和亲和能。
  C.2. 用TDDFT计算原子和分子的（单重、三重）激发态和振荡强度。
D. 移动原子，改变晶胞参数
  D.1. 用不同的方法寻找平衡构型。可以同时优化晶胞参数。优化过程中如果需要的话，可以固定指定的晶胞参数，角度，或原子位置。
  D.2. 有两种算法进行分子动力学计算。
  D.3. 自动分析键长键角。原子坐标的格式支持用可视化软件XMOL显示。
E. 分析和图形工具
  E.1. 后期处理程序cut3d用于分析密度和势文件。它还可以改变文件格式，提取2D明面或者1D线。此外还可以分析波函文件。
  E.2. 另一个后期处理程序aim，用于进行Bader的“原子中的分子”（AIM）密度分析。
  E.3. 对可视化程序产生格式化数据：键结构（用XMGR显示），不同参数的总能量（用XMGR显示），电荷密度（3D轮廓线，先用cut3d，再用商业程序matlab；cut3d也可以产生2D密度图）。
  E.4. 后期处理程序band2eps自动画出eps格式的声子散射曲线。

平台：各类Unix/Linux，Win98/Dos

相关软件：

1. FHI98PP

2. JMol

3. Xtal

4. XtalEdit

5. MAPS

6. http://theory.lsi.polytechnique.fr/codes/codes.html
一些GW程序，有的包含在ABINIT中，有的具有到ABINIT和PWSCF的接口。

jiangzhijie

初来乍到，在哪里下载呢？

greencalm

加入qq群 共享内有

mink

不知那位大侠知道abinit的建模步骤
还有，对于abinit的output文件如何分析？？
abinit的中文西文说明较少
望大侠们告知一二

kunlun

有人做了一个ABINIT的使用手册，已经上传到qq群共享了。

greencalm

在4922649这个群里

peahen

Sorry no chinese input.

Even though ABINIT has a lot of more advantages compared to other ab initio package in terms of the functionalities, I have to conclude that its most attractive feature is its free of charge [s:1]. I say so because I know most of first principle simulation packages would cost you $$. As a GNU project, everybody can contribute to the development of the code, so it's improved by the users. But other than the money issue, I think abinit did a rockn good job in implementing the DFT and DFPT. Just because it is free does not mean it is worse than the commercial code (Linux vs. Windows would give us a good example  [s:1] . IMHO, it's much better than some codes I used in many aspects. You may easily get the technical support by checking its websit (very nicely organized, very instructive tutorial) and joining the mailing list. There are tons of examples covering a variety of fields that you may be interested in. There are also bunch of tools for analyzing the output results, although you can choose to do it yourself. Abinit has much more input variables, which gives your more flexibility and enable you to have more control of what's goint on during the calculation.  I am sure it would bring your surprise, as it did to me, if you try it out.

xiaomagh

我想看看ABINIT的使用手册，不知版主意下如何？
我怎么加不到群里去啊？我得QQ是55597002

lclrabbit

abinit功能表里说能自动分析键长键角，是在输出文本中自动产生吗？我怎么没有看出来啊！哪位能给我说一下怎么得到键长键角，谢谢